WebSite-Trabalho Prático
Laboratórios de Bioinformática – 2017/2018
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Trabalho realizado
Análise de literatura
Análise da sequência
Análise de homologias por Blast
Análise de proteínas
Bases de dados de domínios de proteínas
Alinhamento múltiplo e filogenia
Regulação das vias metabólicas
Tabelas resumo
Ferramentas utilizadas
Scripts desenvolvidos
Legionella Pneumophila
Análise da sequência e das features presentes no NCBI
Nesta etapa foi solicitado o desenvolvimneto de scripts em BioPython que permitam:
Acesso ao NCBI e guardar o ficheiro correspondente ao genoma do organismo filtrando uma lista de genes de interesse para a nossa via
Verificação das anotações correspondentes aos genes de interesse,nomeadamente as do tipo CDS e gene
Verificação e análise de toda a informação complementar fornecida pela lista de features e seus qualifiers
Apresentamos de seguida os scripts que elaboramos: (SCRIPTS)
